Parmesan by Any Other Name

Parmesan by Any Other Name (+ Phylogenetic Trees)
Italians define Parmesan (or Parmigiano-Reggiano) as a cheese made using particular (traditional) practices in a particular region of Italy. American “parmesan” does not meet this definition. Students will be given DNA sequences of bacteria from American “parmesan” and Italian Parmigiano-Reggiano cheeses, and use these sequences to make predictions about how similar or different the two cheeses are. This “+ Phylogenetic Trees” version additionally has students use an online tool to build a phylogenetic tree, to more accurately evaluate the relatedness of the various bacteria. Students need to have some basic knowledge of how to interpret a phylogenetic tree to successfully complete this version.

Parmesan by Any Other Name (variation without phylogenetic trees)
Italians define Parmesan (or Parmigiano-Reggiano) as a cheese made using particular (traditional) practices in a particular region of Italy. American “parmesan” does not meet this definition. Students will be given DNA sequences of bacteria from American “parmesan” and Italian Parmigiano-Reggiano cheeses, and use these sequences to make predictions about how similar or different the two cheeses are. The “No Trees” version relies on basic bacterial identification using BLAST, and the diversity of bacteria present to evaluate the cheeses. This version is appropriate for elementary and middle school students.

NOTE: students may need to learn and practice BLAST if they haven't already acquired this skill.

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Parmesano por cualquier otro nombre (+ árboles filogenéticos) 

Los italianos definen al queso Parmesano (o Parmigiano-Reggiano) a los quesos fabricados mediante métodos tradicionales en una región específica de Italia. El queso “Parmesano” Americano no cumple con esta definición. A los estudiantes se les entregará secuencias de ADN de bacterias provenientes de quesos “Parmesano” Americano y Parmigiano-ReggianoItaliano, y utilizarlas para realizar predicciones acerca de que tan similares o diferentes son estos quesos. En esta versión “+ árboles filogenéticos”, los estudiantes utilizarán una herramienta en línea para crear un árbol filogenético, para así evaluar de manera mas precisa el parentesco de las diferentes bacterias. Los estudiantes necesitarán conocimientos básicos para interpretar un árbol filogenético y completar de manera satisfactoria esta actividad.

Parmesano por cualquier otro nombre (sin árboles filogenéticos) 

Los italianos definen al queso Parmesano (o Parmigiano-Reggiano) a los quesos fabricados mediante métodos tradicionales en una región específica de Italia. El queso “Parmesano” Americano no cumple con esta definición. A los estudiantes se les entregará secuencias de ADN de bacterias provenientes de quesos “Parmesano” Americano y Parmigiano-ReggianoItaliano, y utilizarlas para realizar predicciones acerca de que tan similares o diferentes son estos quesos. En esta versión “sin árboles filogenéticos”, se basa en la identificación básica utilizando BLAST, y en la diversidad de bacterias presentes para la evaluación de los quesos. Esta versión es apropiada para estudiantes de escuelas primaria e intermedia (elementary and middle school).

NOTE: students may need to learn and practice BLAST if they haven't already acquired this skill.

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Photo by  Barbara Skinner  under CC BY-NC-SA 2.0

Parmesan Making 054 by Barbara Skinner under CC BY-NC-SA 2.0